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UF2078 EXTRACCIÓN, AMPLIFICACIÓN, SECUENCIACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS APLICANDO TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR (UF2078)
 
Duración en horas:  60
OBJETIVOS  
- Aplicar las técnicas de extracción de ácidos nucleicos, proteínas y otros metabolitos.
- Usar técnicas de clonación de ácidos nucleicos empleando procedimientos básicos de ingeniería genética.
- Aplicar métodos de secuenciación, caracterización y elucidación de proteínas y estructuras químicas de otros metabolitos de interés.
CONTENIDOS  
UNIDAD FORMATIVA 1. EXTRACCIÓN, AMPLIFICACIÓN, SECUENCIACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS APLICANDO TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR
UNIDAD DIDÁCTICA 1. APLICAR TÉCNICAS GENERALES DE BIOLOGÍA MOLECULAR EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO.
Electroforesis: fundamentos, tipos mono y bidimensional:
- Preparación de geles.
- Revelado de bandas de cadenas.
- Clasificación y almacenamiento de los residuos electroforéticos.
- Procesado y registro de imágenes.
Análisis de imágenes de geles.
Espectroscopia de visible, UV, IR.
Espectroscopia de fluorescencia molecular.
Espectrofotometría de masas.
Cromatografía -columna flash, TLC y HPLC-.
- Tipos de rellenos de columnas cromatográficas -resinas de absorción y adsorción, gel de sílice fase normal y fase reversa, intercambio iónico, cribado molecular.
Conceptos básicos de resonancia magnética nuclear.
Tecnología de alto rendimiento-high throughput- en genómica, proteómica y metabolómica.
UNIDAD DIDÁCTICA 2. CONCEPTOS GENERALES DE ÁCIDO NUCLEICO.
Bases nitrogenadas.
Estructura y función de ADN y ARN.
Replicación.
Desnaturalización ADN.
Conceptos de gen, operones, promotores y secuencias consenso.
Genomas y cromosomas.
UNIDAD DIDÁCTICA 3. APLICAR LAS SECUENCIAS MARCADAS EN LOS PROCEDIMIENTOS ESTABLECIDOS PARA AISLAR ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS.
Extracción, purificación y análisis espectroscópico y/o electroforético de ADN y ARN.
Amplificación por PCR.
Programación del termociclador con temperaturas, tiempos y ciclos preestablecidos.
Concepto de PCR a tiempo real.
Determinación de tamaño y mapas de restricción.
Visualización de geles.
UNIDAD DIDÁCTICA 4. UTILIZACIÓN DE TÉCNICAS GENÓMICAS APLICABLES EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO.
Análisis de genomas:
- Secuencias automáticas y construcción de contigs: phred-phrap-consed.
- Anotación de genomas: métodos y estrategias. Anotación automatizada vs anotación manual.
- Recursos online: ENSEMBL, NCBI, UCSC, TIGR.
Taxonomía microbiana molecular por secuenciación parcial de genes ribosomales.
Análisis de secuencias.
Elaboración de dendogramas y filogenias.
Clonación: concepto, vectores y enzimas de restricción, ligación y expresión.
Hibridaciones Northern -ARN- y Southern -ADN-.
Hibridación in situ.
Huella genética «DNA Fingerprinting»:
- Concepto y aplicaciones.
Cluster de genes de biosíntesis de metabolitos secundarios:
- Nociones y aplicación.
Tecnología de Microarrays y Chips de ADN y ARN:
- Concepto y aplicaciones.
UNIDAD DIDÁCTICA 5. CONCEPTOS GENERALES DE PROTEÍNAS.
Definición.
Aminoácidos.
Estructura, conformación y función de proteínas.
Clasificación de proteínas en base a secuencia. Bases de datos: Pfam, PROSITE, ProDom, SMART, InterPro, COGs.
Predicción de estructura secundaria.
Alineamientos estructurales.
Clasificación estructural: bases de datos: SCOP, CATH, FSSP.
Predicción de estructura terciaria. Modelado.
Transcripción y traducción.
UNIDAD DIDÁCTICA 6. UTILIZACIÓN DE TÉCNICAS PROTEÓMICA APLICABLES EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO.
Extracción de proteínas desde biomasa microbiana o celular:
- Técnicas y seguimiento.
Purificación y análisis por espectroscopia de masas y electroforesis bidimensional tipo SDS-PAGE.
Detección de proteínas por «Western blot», ELISA, técnicas inmunohistoquímicas.
Proteínas recombinantes: Tecnología y aplicación.
Nociones sobre tipos de dianas proteicas más relevantes empleados en cribado-screening.
UNIDAD DIDÁCTICA 7. APLICAR NORMAS DE SEGURIDAD Y DE PROTECCIÓN AMBIENTAL.
Buenas prácticas de procesos y de laboratorio.
Procedimientos escritos normalizados sobre seguridad.
Manuales de uso de los equipos.
Equipos de protección individual.
Manual de uso de los equipos de prevención y respuesta a la emergencia.
Legislación y normativa sobre biotecnología.
Documentación necesaria para la utilización de los productos y/o servicios biotecnológicos resultantes.